Nem sempre Cavalcanti.
Tive um Emac que as vezes eu ligava e ele fazia um som de Tuuuuuuuu e depois uma tela branca em que tinha de digitar "boot from hd" daí ele entrava normal. As vezes como você descreveu. Levei na AT, ainda em garantia e eles trocaram a pilha da placa. O problema ficou mais espaçado mas continuou. Daí resolvi fazer um Upgrade de RAM e para minha surpresa o problema acabou. Desconfiei dos pentes originais de RAM.
No meu caso... nada a ver com HD.
Mas acho que você deve manter seu Backup em dia, sei lá. Esse ícone da interrogação é quando o Mac não acha o sistema. Pode ser que seu HD esteja com a trilha de boot corrompida, acho difícil isso pois se assim fosse ele não acharia o sistema depois. Coloque o DVD/CD do Tiger e passe o Disc Utility, mande arrumar o disco e depois as permissões.
Agora dê uma olhada na preferência do sistema e veja em disco de inicialização se não tem uma opção marcada diferente do HD Original do seu Emac.